Леонид, добрый вечер!
Покупка автомобиля на организацию (юридическое лицо) осуществляется также как и на физическое лицо, за тем исключением, что в ПТС вместо реквизитов собственника-гражданина вписывается наименование собственника-организации. Далее для управления таким автомобилем необходим тот же набор документов: свидетельство о регистрации ТС, в/у водителя и полис ОСАГО и в установленных случаях (если автомобиль используется в коммерческих целях) заполненный путевой лист.
С вопросом покупки подержанного авто по безналу лучше уточнить у конкретного салона - никаких причин не работать по безналу я лично не вижу. Более того, возможно, будет выгоднее приобрести автомобиль в лизинг. Если автомобиль будет покупаться на баланс организации, то, насколько я знаю, его стоимость подлежит вычету из облагаемого дохода.